Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Olfr543-202ENSMUST00000219647 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm1758-201ENSMUST00000164528 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm8991-201ENSMUST00000073014 1075 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms