Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm8203-201ENSMUST00000173192 387 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Slc17a3-203ENSMUST00000110422 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Smt3h2-ps2-201ENSMUST00000122370 288 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Rsrc2-208ENSMUST00000182309 1595 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm45846-201ENSMUST00000211170 446 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Grxcr2-201ENSMUST00000097591 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Tmbim7-201ENSMUST00000014673 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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PtprdQ64487 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm14654-201ENSMUST00000118620 447 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Wdr25-201ENSMUST00000047115 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprdQ64487 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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