Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29445-202ENSMUST00000189947 1497 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28458-202ENSMUST00000190542 1497 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gtpbp6Q3U6U5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gtpbp6Q3U6U5 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gtpbp6Q3U6U5 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gtpbp6Q3U6U5 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gtpbp6Q3U6U5 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gtpbp6Q3U6U5 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gtpbp6Q3U6U5 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gtpbp6Q3U6U5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gtpbp6Q3U6U5 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Gtpbp6Q3U6U5 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Gtpbp6Q3U6U5 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr371-202ENSMUST00000218663 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 CT025630.3-201ENSMUST00000228798 835 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Mfap5-201ENSMUST00000032210 946 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221 ms