Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm12696-201ENSMUST00000122361 905 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 1700016H13Rik-202ENSMUST00000119824 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms