Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl7Q03366 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms