Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Sf3a3-201ENSMUST00000030734 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Trex1-202ENSMUST00000112053 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Rps9-205ENSMUST00000126562 896 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm13855-201ENSMUST00000145644 744 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Mrgpra3-201ENSMUST00000176369 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm19412-202ENSMUST00000189156 569 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 AC167234.1-201ENSMUST00000219929 279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm6960-201ENSMUST00000051629 639 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm4925-201ENSMUST00000092231 397 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Add2-201ENSMUST00000032069 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Mettl8-204ENSMUST00000112186 2347 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm5397-201ENSMUST00000121081 1453 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gpr151-201ENSMUST00000054738 1633 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm15369-201ENSMUST00000119681 394 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm6467-201ENSMUST00000171547 609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm32496-201ENSMUST00000191988 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Trav4-1-201ENSMUST00000199078 330 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Ccdc153-206ENSMUST00000216632 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Cd1d2-201ENSMUST00000041920 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Katna1-202ENSMUST00000165806 1775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Katna1-201ENSMUST00000019929 1774 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Hsd17b6-202ENSMUST00000219183 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Ndufa9-203ENSMUST00000205002 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Kcnk2-209ENSMUST00000194402 1373 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Mir675-201ENSMUST00000102320 84 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm13472-201ENSMUST00000120948 314 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 D730045A05Rik-201ENSMUST00000159260 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm16301-201ENSMUST00000161959 295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Kcne3-204ENSMUST00000179842 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm2324-201ENSMUST00000187464 662 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm37065-202ENSMUST00000192000 568 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Cdca8-201ENSMUST00000030690 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Pla2g2a-201ENSMUST00000077582 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Cd1d2-203ENSMUST00000194208 1527 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms