Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtpreP49446 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtpreP49446 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtpreP49446 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtpreP49446 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtpreP49446 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtpreP49446 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtpreP49446 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtpreP49446 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtpreP49446 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtpreP49446 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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