Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp4P35123 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms