Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm13844-201ENSMUST00000134541 581 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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