Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 A430072C10Rik-201ENSMUST00000197848 2532 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Nfatc1-203ENSMUST00000167977 4604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Tpp2-207ENSMUST00000188313 4631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm16536-201ENSMUST00000162209 1589 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Mapk6-201ENSMUST00000049355 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Pcdhb11-201ENSMUST00000053073 4419 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Scml4-202ENSMUST00000105494 4166 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Nkiras1-202ENSMUST00000132374 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Nedd4l-211ENSMUST00000226058 3393 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Cntrob-201ENSMUST00000092973 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 AC113125.1-201ENSMUST00000226852 1774 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ammecr1l-201ENSMUST00000115808 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Cass4-203ENSMUST00000109136 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Tecta-201ENSMUST00000042190 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ep400-203ENSMUST00000112435 10420 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Foxp2-205ENSMUST00000115474 2544 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Sepsecs-201ENSMUST00000031069 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm39323-201ENSMUST00000215913 2942 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 C6-204ENSMUST00000162585 2876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Khdc1a-201ENSMUST00000088407 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Bcas3-206ENSMUST00000108062 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Mylk3-201ENSMUST00000034133 3696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms