Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 1700010I14Rik-203ENSMUST00000151609 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 A430093F15Rik-201ENSMUST00000087947 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms