Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28036V9GXJ1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm28036V9GXJ1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28036V9GXJ1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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