Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdfS4R2K0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms