Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top3bQ9Z321 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms