Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Hdac5Q9Z2V6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hdac5Q9Z2V6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms