Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vamp5Q9Z2P8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms