Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mbd3Q9Z2D8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms