Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rps6ka4Q9Z2B9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Rps6ka4Q9Z2B9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms