Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn8Q9Z260 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms