Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X2

Ptdss2, Phosphatidylserine synthase 2, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptdss2Q9Z1X2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ptdss2Q9Z1X2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptdss2Q9Z1X2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms