Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms