Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfkbiaQ9Z1E3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms