Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf1Q9Z1B8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf1Q9Z1B8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms