Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z184

Padi3, Protein-arginine deiminase type-3, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi3Q9Z184 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Padi3Q9Z184 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Padi3Q9Z184 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Padi3Q9Z184 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Padi3Q9Z184 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Padi3Q9Z184 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Padi3Q9Z184 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Padi3Q9Z184 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Padi3Q9Z184 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Padi3Q9Z184 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Padi3Q9Z184 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Padi3Q9Z184 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Padi3Q9Z184 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Padi3Q9Z184 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Padi3Q9Z184 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Padi3Q9Z184 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Padi3Q9Z184 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Padi3Q9Z184 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Padi3Q9Z184 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Padi3Q9Z184 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Padi3Q9Z184 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Padi3Q9Z184 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Padi3Q9Z184 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Padi3Q9Z184 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Padi3Q9Z184 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Padi3Q9Z184 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Padi3Q9Z184 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Padi3Q9Z184 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Padi3Q9Z184 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Padi3Q9Z184 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Padi3Q9Z184 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Padi3Q9Z184 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Padi3Q9Z184 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Padi3Q9Z184 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Padi3Q9Z184 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Padi3Q9Z184 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Padi3Q9Z184 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms