Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ror1Q9Z139 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ror1Q9Z139 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms