Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms