Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn15Q9Z0S5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Cldn15Q9Z0S5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn15Q9Z0S5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms