Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn3Q9Z0G9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn3Q9Z0G9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms