Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Pacsin2Q9WVE8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pacsin2Q9WVE8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pacsin2Q9WVE8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pacsin2Q9WVE8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180 ms