Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx1Q9WV80 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx1Q9WV80 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx1Q9WV80 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms