Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP7

Uchl5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl5Q9WUP7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uchl5Q9WUP7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uchl5Q9WUP7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms