Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nrf1Q9WU00 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms