Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slit2Q9R1B9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slit2Q9R1B9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slit2Q9R1B9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slit2Q9R1B9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slit2Q9R1B9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slit2Q9R1B9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slit2Q9R1B9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slit2Q9R1B9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Slit2Q9R1B9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slit2Q9R1B9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slit2Q9R1B9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Slit2Q9R1B9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slit2Q9R1B9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slit2Q9R1B9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slit2Q9R1B9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Slit2Q9R1B9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms