Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed2Q9R0Q3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tmed2Q9R0Q3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms