Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf346Q9R0B7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf346Q9R0B7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms