Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nek3Q9R0A5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek3Q9R0A5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms