Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AmfrQ9R049 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AmfrQ9R049 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms