Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsjQ9R014 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CtsjQ9R014 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms