Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf4Q9QZS2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms