Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms