Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE2

Clnk, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClnkQ9QZE2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClnkQ9QZE2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ClnkQ9QZE2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms