Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ubxn8Q9QZ49 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ubxn8Q9QZ49 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms