Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnnt3Q9QZ47 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnnt3Q9QZ47 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms