Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

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Length 761 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phtf1Q9QZ09 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Phtf1Q9QZ09 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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