Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rdh11Q9QYF1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rdh11Q9QYF1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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