Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hacd1Q9QY80 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hacd1Q9QY80 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hacd1Q9QY80 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hacd1Q9QY80 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hacd1Q9QY80 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hacd1Q9QY80 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hacd1Q9QY80 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hacd1Q9QY80 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hacd1Q9QY80 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hacd1Q9QY80 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hacd1Q9QY80 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hacd1Q9QY80 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hacd1Q9QY80 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd1Q9QY80 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms