Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nufip1Q9QXX8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nufip1Q9QXX8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nufip1Q9QXX8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms