Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cbx8Q9QXV1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cbx8Q9QXV1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms