Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pcsk1nQ9QXV0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pcsk1nQ9QXV0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms