Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad18Q9QXK2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad18Q9QXK2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms